La Oficina de Presupuesto fue creada en Agosto de 1978 con el nombre de Oficina de Presupuesto y Finanzas, em 1997 cambia a su nombre actual, dentro de la estructura de la Dirección Financiera, asdcrita a la Vicerrectoría Ejecutiva.
Actualmente la Oficina de Presupuesto está a cargo de la MBA. Mabel León Blanco, quien tiene a su cargo a los siguientes funcionarios:
- Ericka Moya Navarro
- Maribel Chinchilla Sojo
- Grace Alfaro Alpizar
- Luis Paulino Calderón Sibaja
- Javier Wady García Trejos
- Elian Valerio Valerio