Actualmente, la Maestría cuenta con cuatro énfasis que el estudiante inicia al cuarto cuatrimestre de su carrera y son: Gestión de Proyectos, Gerencia Estratégica, Mercadeo Estratégico o Recursos Humanos. No obstante, la apertura del énfasis depende si existe el número mínimo de estudiantes.

El plan de estudios comprende seis ciclos, tres que son comunes y tres que son de énfasis y trabajo final de graduación, según el detalle: